本校一直以提升學生學習能力為目標，近年透過「從閱讀中學習」及初中專題研習提高課堂參與，並於課後及假期開設中、英、數科研習班與功課輔導以鞏固基礎。同時，教師積極進修培訓，採用創新教學法以培養學生自學能力。現時由中一至中六全面推行自攜裝置（BYOD），並引入多個人工智能平台，進一步提升學與教效能與學習成效。

為全面照顧學生個別差異，本校調配開辦班級的資源，將中一至中三的編排比原編配多一班。中四至中六則由2024-2025年度起，逐步按學生的語文能力分組，使老師能有效照顧學生的學習需要。本校學生善用不同的電子學習工具配合課堂前後的自主學習策略，並結合翻轉課堂、互動電子學習平台及人工智能平台等，透過課堂前後、正規課堂或假期來推行，以達至拔尖補底及提升學生自主學習能力的目的。

全校各室均有空調設備。除基本標準中學設施外，另設有升降機、英語咖啡閣、校園電視台、 STEAM學習室、電腦輔助教學室各一間、模擬飛行訓練中心。另於2021年增設再生能源及可持續發展學習資源中心，以推動STEM及環保教育工作。全校課室及特別室皆設有電子學習互動黑板、電腦、實物投影機、內聯網及投影機。同時，學校由中一至中六全校實施BYOD，配合全校WIFI的鋪設，以促進電子學習。

本校致力推行全方位學習活動，包括價值觀教育、智能發展、社會服務、體藝發展、與工作有關的經驗等，令學生在各學習領域都有均衡的發展和豐富的收穫。而學生活動分為宗教、服務、興趣、運動、學科、領袖訓練等各大類別，超過三十個學生活動組別，其中包括撒母耳團契、公益少年團、童軍團、STEAM學會、電腦學會、圓．創映畫、衡戲、舞蹈學會、咖啡學會、薈藝園、隨心．繪、田徑學會、足球學會、籃球學會、羽毛球學會、劍擊學會、中文學會、英文學會、數社、科學學會、中史學會、地理學會、先鋒領袖訓練及學生會等。
同時，本校於中一正規課時引入中一「潛能盡展」計劃，全日課逢週五讓中一學生有發掘及發展潛能的機會，讓學生從「潛能盡展」重點學會的培訓中鍛鍊自己，讓他們參與公開比賽或表演，從而獲得成就感，增強他們的自信和學習的動力，讓他們更投入校園生活，增添歸屬感。而每年學期期間的「衡怡SHOW　TIME」攤位日及學期尾的「衡怡SHOW　TIME」表演日更分別為同學建立展現自己的機會及表演的舞台，展示過去一年的學習成果。